硕士论文查重是保障学术诚信的重要环节，常见的查重方法包括利用查重软件、手工对照、文献比对等。首先，利用专业的查重软件如Turnitin、iThenticate等进行查重是最常见的方法之一。其次，可以通过手工对照的方式，逐字逐句地检查论文中的内容是否存在抄袭。另外，还可以通过文献比对的方式，查找论文中引用的文献在其他文献中的原文，以确定是否存在抄袭行为。

在进行硕士论文查重时，需要注意避免以下几种情况：一是避免直接复制粘贴他人的观点和文字，应该进行合理的引用和注释；二是不要只依赖查重软件的结果，应该结合手工对照和文献比对等多种方法进行查重；三是及时修改论文中被查重软件标记出的重复内容，保证论文的原创性和学术诚信。